小规模纳税人年度开票超过100万，不免税的情况下，仍需要缴纳增值税。增值税是我国税制的核心内容之一，是一种消费税，它按照货物和劳务生产销售的税收来源，税收机关按照增值额段来确定不同税率。 小规模纳税人一般是按照3%征收增值税，即适用税率为3%，且免抵扣进项税额。此外，小规模纳税人所得的营业税或增值税，应当按月申报，申报日期在每月最后一个税务登记日以前。 小规模纳税人若超过100万销售额，就要满足一定条件，以符合小规模纳税人的资格，也就是其销售额必须在500万以内，否则，就要脱离小规模纳税人的资格。 增值税的一般处理方法：发票开具完毕后，根据购置方的发票信息报送国家税务总局，由国家税务总局进行校验并制证进行抵扣，最终由购置方到税务机关上缴，在发票开具和上缴期间，企业可以有效控制增值税流程，避免不必要的税收风险。 拓展知识：小规模纳税人，所得额达到认定标准的，应当按照小规模纳税人的税率征收增值税，一般来说，小规模纳税人实行简易征税制度，可以享受更多的税收减免和优惠待遇，以降低纳税负担。