建筑企业总包代发工资，个税由总包代扣代款还是分包代扣代缴，这取决于分包单位是否设定为“根据总包代发工资的单位的支付人”。如果设定，则由总包代发工资，并由总包担任缴纳个人所得税的责任人，代扣代缴个人所得税；如果没有设定，则由分包履行缴纳个人所得税的义务，代扣代缴个人所得税。 在代发工资时，企业必须根据缴纳个人所得税的义务来判断是否需要扣缴个人所得税，因为个税的税额是根据个人的工资来计算的，所以总包发放工资时，必须把个人的工资计入全部工资中去，然后再根据个人的薪资水平来支付税款。 拓展知识： 总包在代发工资时，除了要代扣代缴个税外，还要依据《企业所得税法》及《上海市企业所得税税收收入管理办法》等规定，按照规定汇缴社会保险费、住房公积金等。为此，企业总包在发放各类费用时，需要把这部分费用单独计算，以保证各类费用得以清晰地报送并缴纳。