可以的，按照《国家税务总局关于推进增值税进项税额留底抵扣政策若干问题的通知》规定，一般纳税人可以申请留底抵扣，月底申报时留底抵扣额度不能超出进项税额3个月累计额度，所以你这笔进项税额允许抵扣50万，将本月未用完的进项税额留底，剩余50万留着慢慢抵扣处理也是可以的。 要放心运用留底抵扣政策，建议企业要正确确认和把握期间内的各类重要的税金变动情况，了解当期应纳税额的计算方法，并结合自身经营情况现金流量变动，及时审视自身的抵扣政策，防止抵扣额度的过剩。同时，建议企业通过财务软件计算抵扣额度，以保证税负的合理性。