新公司注册中介代办的服务费账务处理的常规流程是：首先财务部门根据账单支付服务费，然后交给中介公司；中介公司通过财务报表将服务费发放到中介公司的账户；中介公司收到服务费后，将服务费进行记录，然后填写收支报表；这一过程完成后，上传至有关部门，提供该公司服务费账务处理的证明材料。拓展知识：服务费账务处理不仅仅包括支付和记录这两个部分，还要根据相关政策，签订金融类的协议，实行资金监管，确保费用可以正常支付和使用，以避免给公司及中介机构带来不必要的风险。