当直营店作为分公司核算时，可能会造成一些财务问题，比如会导致税务局把这些营业额包含在总公司的税收范围内，导致总公司的税收负担增加。此外，当直营店作为分公司核算时，公司可能不能全面掌握直营店的运营成本及收益，也可能会出现资金流动性不足的问题。 规避的方法有：首先，公司可以建立一套完善的预算财务体系，及时监控各直营店的收入和支出情况，对应做出合理的调整；其次，公司可在向直营店提供半成品时，采用一定的赊销管理模式，克服资金流动性不足的问题；此外，公司还应提高企业管理水平，加强内部政策和流程的贯彻，有助于提升企业的经营管理能力。 在实践中，公司可以采取积极的筹划，将负责税收相关的专业人员纳入企业管理团队，给予指导和培训，并做出明确的适用政策，以便在一定程度上规避此类问题的出现。另外，财务部门也应该注意这些问题，及时发现和改正，以便准确核算各直营店的纳税情况。