职工医保扣费通常是通过社保费管理客户端来完成的，一般社会保障局会提供一个客户端给企业，企业可以在客户端上添加职工信息，并记录各项费用，比如医疗费用、住院费用、住房公积金等，企业可以在客户端上记录相关费用，从而方便社会保险中心的管理。拓展知识：此外，若企业集团有多个分支机构，企业集团可以使用集中式财务管理系统，实现对跨分支机构社会保险费用的集中管理，从而大大简化企业的财务管理流程，加快企业的财务处理速度和效率。