电子普票作废的话，一般需要经过正规的流程来处理。首先，应仔细核对电子普票是否完整无误，以避免重复红冲，确定电子普票存在瑕疵或作废的情况，查验原因；然后，进行红冲操作，如涉及税款扣收，需做好相关记录；最后，如确有作废的情况，办结电子普票作废登记及相关证明文件，并将原张电子普票和相关证明文件同时提交财政部门，财政部门确认后才算正式作废。拓展知识：电子普票作废，一般是因为发票号码有误，或者是发票内容有误，又或者是订单取消原因等原因才会进行作废处理，作废后应该把正确的发票更换出来，以免影响发票的真实性。