收到留底退税入账科目取决于留底退税的性质，有三种情况： 1、如果是自己办理留底退税，收到留底退税入账科目为：借方：“应收税款”；贷方：“银行存款”。 2、如果是有税务机关指定的会计师事务所代办的留底退税，收到留底退税入账科目为：借方：“应收税款”；贷方：“应付款-会计师事务所”； 3、如果是汇算清缴税收，收到留底退税入账科目为：借方：“应收税款”；贷方：“银行存款”。 拓展知识：对于收到的留底退税，公司往往需要扣缴税收，这种税收可以分为两部分：预缴税收和年终纳税申报。预缴税收是指使用会计科目“应交税费”向税务机关缴纳预缴税收，比如个人所得税、企业所得税等；而年终纳税申报是根据报表填制税务机关的税收申报书，向税务机关申报补缴税收，包括企业所得税、个人所得税和增值税等。