小规模企业开具增值税专用发票的税率为3%。根据《中华人民共和国增值税暂行条例》（2013年修订）第四十二条，分别以3%、1.5%和1%收取增值税，对小规模纳税人开具的增值税专用发票计征税率为3%。实行小规模纳税人免征增值税的，应当在确定税务登记信息准确无误的情况下，建立小规模纳税人免征增值税的政策，小规模纳税人应当开具增值税专用发票，增值税以3％计征。 拓展知识：对于企业开具增值税专用发票，税率可以按照国家规定分为3%、1.5%和1%三种，具体税率根据不同企业的纳税依据而定，小规模纳税人免征增值税可以申请纳税服务厅免税。企业在开具增值税专用发票时，要认真核对纳税人识别号，将折扣征收税率和税额等信息准确无误地核实，以确保专用发票的正确开具。