工程施工企业根据开票确认收入，成本的结转应该按照如下步骤： 1、收到材料票劳务票时直接挂在工程施工科目下面，不结转，待开票确认收入时，按照实际施工费用累计结转至主营业务成本。 2、注意，工程施工企业施工成本在结转到主营业务成本之前，仍需验收点确认。 3、施工成本结转到主营业务成本时，要根据报销金额和实际施工费用额度来结转，并将结转到主营业务成本的部分以贷方记账，其余费用以借方记账。 拓展知识：工程施工企业还需注意主营业务成本的核算，收取施工费用时应根据规范向客户收取，并将费用正确地归入到相应的主营业务成本中，确保企业的利润状况。