当回单和个税申报系统的不一致时，应该按回单做凭证。因为回单中包含了申报结果和实际缴纳数额，是个税最终结果，而申报系统只是记录用户申报数据，不能反映用户最终缴纳情况。为了核实客户缴纳个税情况，需要按照回单的数据做凭证，以保证客户申报和最终缴纳的信息正确性。 此外，为了更准确的申报和核实缴纳情况，客户应仔细检查自己在申报系统中输入的信息是否可以与最终缴纳数据一致，如果不一致，可以及时通知税务机关核实情况。拓展知识：另外，个税的减免待遇也要注意，如子女教育，住房贷款及公积金，结婚等减免项目，都要由客户自行在申报系统中进行申报操作，并保存相关的发票和凭证，以备审核和核实。