1.首先，我们需要确认运输公司是否就损失的货物赔偿20000元的费用进行了书面确认，并收取其赔偿费用的发票，并加入记账凭证； 2.然后，我们要使用按照标准科目分类编制的记账凭证，将赔偿收入20000元归入应收账款科目，即收入20000元； 3.再将20000元归入其他应付账款科目，即支出20000元； 4.最后，在收出的发票上签字确认，并与记账凭证对照； 拓展知识：记账凭证是由各种交易行为所发生的可证明的经济关系，由销货单、购货单、付款凭证和收款凭证等记载交易情况的书面凭证，附上当次经济交易双方账户核对情况。