首先，要解决企业在ipo三年期间发现的因工单结案而退料问题，应该从法律和会计准则的角度来考虑，材料的结转处理也就是一个记帐流程。根据中国会计准则，企业在ipo三年期间应当进行爆灯成本分析，确定材料的结转方式。如果材料不能够结转，则应当将其计入成本费用。根据《中华人民共和国会计管理条例》，成本费用可以在会计期初结转到应收帐款，或者作为当期支出发生，并进行记账凭证的记录。综上所述，企业在ipo三年期间发现的材料因工单结案而退料，可以根据企业不同情况，将材料计入成本费用，或者结转到应收帐款，要根据真实情况进行处理，以确保企业财务状况的合法、合规。另外，企业在使用虚拟帐户进行记账时，也要小心，否则会影响到企业的资金运用。