抵扣发票按照实际发票数量进行计算，也就是说，超市销售农产品进来的发票如果是3个点，则只能抵扣3个点，而不能抵扣9个点。抵扣发票的数量是受有关法律、法规及税务部门的规定约束的，因此需要按照相应的发票数量进行抵扣，以确保抵扣的合理性和可持续性。 拓展知识：税务部门对抵扣发票也有相应的规定，一般情况可以按收到的发票数量抵扣，但有一些特殊情况，比如礼券的使用就要经过税务部门的审核和认可，才能够实现抵扣。