首先，在处理9月发8月工资、9月申报7月个税不一致问题时，我们需要做好记录，把所有拿到的个税凭证，全部记录在本，方便查验。如果8月底个税实际工资表扣的是7个5000，而个税系统里面扣的是8*5000，可以从系统中找到8月份应纳税所得额，然后核实工资表中的实际税额，并且找准个税月份，做好归档，同时把有关的文件准备好，给个税局办理补税。在补税时，可以根据实际情况，根据行政规定，提供税务机关出具的证明文件进行认证，并补交差额部分。此外，个人要提醒大家，在每月缴纳个税时，应全面查验自己的记录，核实个税凭证是否与实际情况一致，及时核实和补充，避免产生不必要的纠纷。