深圳小规模纳税人申请开具发票，可以在税务机关或者网上办理发票开具。在税务机关办理开票，需要准备好税务登记证和营业执照，另外，根据不同纳税人类型，有可能还需要提供其他相关资料，比如组织机构代码证、统一社会信用代码证书等。税收管理部门会在双方核实无误的情况下，进行相应的审批程序，审批通过后，税务机关给出发票号码，完成发票的开具。 目前，深圳市已经开通网上发票系统，网上开具发票相比繁琐的税务机关审批流程更加快捷，只需要纳税人提供必要的税务登记证以及营业执照，并自行输入相关信息，便可以获得发票。 此外，纳税人申请开具发票时，应始终牢记法律法规，遵守国家的发票发行政策，拒不接受任何拒绝遵守的行为，以免引起后果。