当在注册个人所得税系统时，如果显示证件号已存在，请按照以下步骤处理： 1. 检查证件号码是否输入正确，如果输入有误，请重新输入，然后重试注册； 2. 如果证件号码无误，请联系税务机关、纳税服务中心，查明是否已注册个人所得税系统； 3. 如果已注册个人所得税系统，可申请或者重置登录账户，在个人账户中查看历史数据。 拓展知识： 个人所得税系统是政府颁布的一种税收政策，其目的是收取个人对社会所做出的财务贡献。通过开发和使用这个系统，税务机关可以更有效地收取个人税收，为国家经济发展作出更有效的贡献。