一般纳税人从小规模企业购进农产品，开具了普通发票，可以抵扣进项税，但有时也会发生不能抵扣的情况，例如：（1）当购买农产品所获得的普通发票中税率与增值税普通发票中税率不符时，不能抵扣进项税；（2）从非增值税纳税人处购进农产品，开具普通发票时，也不能抵扣进项税。此外，如果从小规模纳税人处购进的农产品，没有开具普通发票，也无法抵扣进项税。 拓展知识：农产品使用普通发票可以抵扣增值税，但是对于一般纳税人，从小规模纳税人处购进农产品，若开具普通发票，只有当购买农产品所获得的普通发票中税率与增值税普通发票中税率相同时，才能抵扣进项税。另外，也可以申请增值税进项税额抵减，企业根据所购纳税用品的实际使用情况的对该纳税用品的税费用进行核减，从而降低税负。