根据相关税务法律，一般纳税人实际上也是有责任对开具发票的收入进行纳税的。而由于刚转为一般纳税人当时，进项税还未开具，而公司又已将销售开出去，所以就会出现应缴税款大于实缴税款的现象，税务局所提出的预警也是由此而来。 在此，你可以提出一个纳税调节申请，将实际应缴税款与实缴税款的差额合并，这部分税款将作为本期税款向税务机关缴纳即可。但是，需要注意的是，在此种情况下，除了要求企业进行调节外，税务机关仍有可能会决定对企业进行相应的罚没金额。 此外，在缴纳税款时，还需要考虑台账的处理问题，注意台账的统计和核定，并确保台账内容是清晰准确的。最后，建议把税务事务处理流程及时记录在台账中，以便于税务机关日后查阅。