是的，在使用财务软件上入账时，如果有多张同一个抬头的发票，可以合并入同一个凭证。这是因为，在财务软件上入账时，采用的是凭证法制度，即每一笔业务的经济性质必须用一张凭证记载，一张凭证可以记载多条借贷方的账目。而在使用财务软件入账时，合并多张发票入账，可以减轻账务人员的工作量，提高工作效率。 除了合并多张发票入账，财务软件也支持将多笔相同类型的收入和支出记录合并在一起，也可以减少手工输入凭证，提高工作效率。