您好，运费是批发化肥公司的成本，在运费的计算上，应该考虑距离的长短及运输的种类，以及化肥的重量，这些都会影响运费的计算。如果仅靠物流公司开发票，很难全面反映化肥公司的运费成本。建议您可以自行维护针对与订购化肥及运输的具体费用记录。此外，您也可以咨询化肥厂家，他们提供的运输优惠政策能够给您的成本带来很大的优势，从而提高您的营业利润。