如果股东投资款超过注册资本比例，在处理时需要特别留意，首先，必须遵守每个股东投资比例的极限，即不能超过股东投资总额和注册资本总额之比，在处理时需要按照企业章程的要求增发股份。股东可以使用多种投资方式，例如购买股票、卖出股票或出售其他资产等。若股东的投资比例超过注册资本比例，企业必须采取合法手段增加扩大注册资本。以便股东的投资比例不超过注册资本比例。 拓展知识：另外，针对企业股东投资比例的调整，法规方面存在一定的专业限制，企业在办理股东投资比例调整时，必须充分考虑企业的经营能力、财务实力等因素，确保企业的正常运营。