分公司付款开票要开总公司，也就是说，由分公司付款，但票据上开的发票由总公司开具。这是因为总公司对分公司的付款有一定的财务审查权，也就是说，分公司只能在总公司有相应的证据证明才能可以付出费用，而此时开具正规发票则只能由总公司完成。 从财务角度来看，由总公司开具发票更能保证发票真实性，总部对公司财务状况的把握也比分公司更为准确，有利于分公司公正合法申请和使用财务资金。 另外，在企业的分支机构和总部的关系中，也有一定的法律法规规定，需要总部审核分支机构的发票情况，以确保公司整体会计制度的正确性和稳定性。 从以上我们可以看出，分公司付款开票要开总公司是一种合理的财务制度，它有利于公司的会计管理，也可以保证企业的正常运转。它不仅是一种保护公司财务资金的有效方式，也能避免出现会计数据失真的情况。