当一名员工涉及到跨公司出差时，补助和差旅费一般由外部公司报销，而不是总公司报销。根据个人所在公司的规定和政策，若公司分部独立报税，则该部门可以自行决定和确定与补助和差旅费相关的政策或补助金额等。一般情况下，只要把具体的差旅费用报销细节报销规定好，则同事就可以得到补助和差旅费的报销补偿。比如，可以给予具体的出差补助标准，规定报销的补助费用，补助的覆盖范围和报销的有效期等。 同时，公司还需要对补助和差旅费的报销进行审查以及拒绝不真实或不合理的报销。公司还可以要求申请人提供相关的旅行凭证，比如机票单据、住宿单据、交通单据等，以便进行审查核实差旅费用的真实性。另外，申请人还需要提供差旅费用的细节报告，以及补助金额的核定凭证。 总之，如果公司分部独立报税，则该部门可以自行设定补助和差旅费用报销的规则，以及提供相应的补助。但是，报销补助和差旅费时，公司大多也需要进行审查，以确保报销补偿支付的真实性。 拓展知识：差旅补助主要指公司支付给差旅人员的旅行费用，用于报销部分旅行费用，如交通费用、住宿费用、餐费等。它不同于差旅津贴，只是补偿旅行费用，而不涉及基础工资。