可以这么操作，但是需要做如下两件事情： 1. 总公司可以先向分公司发起一个货物购买或服务支付的申请，然后由分公司开具发票，通过总公司的支付来实现款项的支付。 2. 总公司应当先向合作方开立一张支付订单，然后分公司将该笔订单录入到总公司，最终由总公司完成支付，并要求分公司开具发票。 以上两种方法都可以用来操作付款，但是需要经过认真的筹划，并符合法律法规的规定。 此外，还有一种拓展的知识，即两家单位之间可以签订一份支付款项的押汇合同。这种合同在支付的时候非常有利于总公司，因为总公司可以先向押汇行开立押汇，然后将押汇交给分公司。分公司收到押汇后，只需凭借押汇就可以从行方收取款项，而无需总公司直接支付给分公司。