是的，总公司申报企业所得税和申报残疾人保障金时的人数都是以总公司的收入为准的。在申报企业所得税时，要加上分公司的所有收入，因为总公司负责管理所有分公司，其收入也要作为总公司收入，以统一计算申报企业税。而在申报残疾人保障金时，只需要根据总公司本身的工资来申报，因为只有总公司自身的员工才享有这项社会保障。所以，在特定情况下，总公司在申报企业所得税和申报残疾人保障金时的人数是不同的。 在实际操作中，需要根据不同情况来分析，因为企业所得税的费用是由各纳税单位（公司）负担的，也就是说，每个纳税单位都要按照自己的实际缴税情况，分别申报企业所得税。同时，申报残疾人保障金时，要统一按照总公司的工资收入来申报，不能由个别的分公司或者其他子单位去申报。 此外，在申报时，企业还需要合理安排记账，开展记账检查，确保准确无误，确保按时向税务机构申报财务数据，妥善处理企业的税务纠纷。最后，还要注意在申报时要遵守本地税收政策，积极应对各种更新政策，把握最新税收变化，以保证企业税收按时准确缴纳。