单位支付的改善乡村人居环境项目工程款应计入两个会计科目：“支出”和“投资支出”。首先，将单位支付的款项记入支出科目，并在该科目中细分出相关项目支出，该科目主要用于记录单位支付的款项；其次，将单位支付的改善乡村人居环境项目工程款记入投资支出科目，投资支出科目主要用于记录单位投资兴建改善乡村人居环境项目的费用总额。 拓展知识：投资支出的计入不仅仅是土地、建筑物等固定资产进行购置的资金，还包括在兴建固定资产时因为设备折旧等原因产生的费用、以及兴建投资项目所需的材料购置、交通运输费用、工程施工费用等支出。凡是属于固定资产兴建的费用，均应归入会计科目“投资支出”中计提，合理有效地记载和控制企业的资金投入和投资收益。