自然人电子税务局申报个税时，当员工离职了，应该先将其注销税籍，及时办理离职手续，填写个人所得税纳税申报表，如果有累计计算的情况，最终累计计算的月份应该小于当前月份；同时需要将历年的个税申报表进行汇总，重新计算并纳税，如果有应补退的情况，一般申报一次即可完成。 拓展知识：为了解决以往缴税不全、纳税不足等问题，中国税务总局更新了纳税申报系统，推出新的“汇总申报”方式，可以根据全年的所得类别、减除费用、赡养费用、住房补贴等，实现所得汇总申报，灵活便捷的实现个人所得税纳税申报。