一般来说，在建工程停用的项目辅助科目，需要将余额转出。首先，根据建账说明，检查项目辅助科目是否停用，如已停用则需将余额转换到合适的科目；其次，查看该项目辅助科目的余额，如果该辅助账户的余额还有剩余，应立即将余额转出，以避免被其他部门因项目未完成而产生的损失；最后，根据财务报告，检查数据的准确性，确保余额的转出没有疏漏。 总的来说，在建工程停用的项目辅助科目余额转出，建账核对、余额检查以及审计是比较重要的步骤，帮助形成财务会计准确、完整的记录，为有效调控实践管控提供帮助。 此外，在转出余额的同时，可以考虑将其转入银行账户进行存管，以利于有效管理财务状况，把握帐务情况，防止挤出或被挤出等情况的发生。