是的，实际付款金额与发票金额不一致时，按实际付款金额入账，发票金额多出来的部分可以依据相关规定进行处理。一般是按照无效发票处理，无效发票有两种：收付双方未签字确认的发票，以及金额超额的发票，可以撤回重开，建议把超额的部分在重开的发票上扣除。此外，也可以向税务机关申请核销；如下账做无效发票处理，可以在“应付账款”科目下支付发票金额，在“应收账款”科目下收取实际付款金额。 拓展知识：按照税务机关的相关规定针对实际付款金额与发票金额的不一致行为，可能会受到行政处罚，所以要认真落实记账凭证的记账准确性，确保金额的一致性，避免受到行政处罚的风险。