是的，你可以让员工分开写两张报销单，一张是有发票的，另一张是没有发票的。你写的报销单是可以的，你只需要复印件发票放在外账，然后把有发票的报销单和发票都复印，再把有发票的报销单和无发票的报销单放在一起放入内账即可。没有发票的报销单可以单独用私人账户转账，或者也可以用公户转账，但是要注意不要把有发票的报销单放在一起。此外，为了确保支付的准确性，最好还是务必核对报销单上所有信息，确保没有错误。为了避免报销出现问题，应该及时做好报销的记录。报销时可以接收发票或其他实物凭据，以作为有效的报销凭证，并定期进行验收，确保报销支付正确无误。