A公司发生的预付款，一般在账务上处理时，要按照 prepaid expenses来记账，具体记账步骤如下，1、先在应付账款分类上，把预付款的金额从应付账款中扣除；2、在费用分类上，增加预付费用的金额；3、签订三方协议后，将预付款明细进行确认，在科目上把预付费用科目做出清账，同时把应付账款做出清账；4、再对预付款明细进行确认，把确认金额按照转换规则，将预付费用更新为应付账款；5、最后，进行报销，把预付款报销给B公司，具体报销步骤可以由B公司进行报销申请，按照流程进行审批，完成报销流程。拓展知识：账务处理时，除了经常使用的贷方、借方外，还可以使用“预付”和”实付”两个操作，可以根据实际情况采用不同方式处理，以确保合同约定的约束条件被正确处理。