九月份社保费已经如期在电子税务局网上申报，但是却没有系统自动扣款，原因可能有以下几点： 1. 余额不足：可能申报时企业纳税账户余额不足，导致系统不能自动扣款； 2. 违规操作：可能申报时用户登录的企业账号存在违规行为，违规的企业不能及时扣款； 3. 系统故障：可能申报时电子税务局系统出现故障，导致不能自动扣款； 4. 专项计算：可能申报时社保费需要经过专项计算，但是这种情况有一定的时间要求，所以扣款暂时延后； 上述可能原因均可能导致社保费未在电子税务局扣款，用户可以根据上述原因，或者咨询税务局热线，确认是否及时扣款。 拓展知识：社保费的基本概念是企业和个人雇主双方向劳动者缴纳的社会保险费，是支持社会保障制度维持运行的费用。社保费由劳动者和企业共同承担，企业缴纳的社保费是劳动者可以享受社会保障待遇的重要保障。