跨月普通增值税发票的作废操作有三种： 1. 手动注销：发票作废时，缴纳税款的纳税人，应当携带发票原件或者复印件到税务机关授权开具发票的税务机关当地税务分局进行报废，税务机关会在发票上签字盖章，表明核销后无效。 2. 电子注销：申报系统提供了电子增值税发票作废程序，纳税人可以自主注销，信息系统后台会自动核销作废发票。 3. 系统注销：在查账系统中设置，纳税人可以自行提交和审批作废信息，由税务机关确认审批通过后，系统会自动核销作废发票。 拓展知识：跨月普通增值税发票作废后，原发票作废，不能用于发票开具，也不能抵扣。发票作废后，根据《增值税改革实施方案》，申报系统会把已作废的发票的金额及税额从纳税人的应纳税额中减去。