合理处理公司没有发票的支出，应该从两个方面入手。首先，应该加强支出管理，如建立完善的财务规章，加强对支出的审核和管理，严格按规定的凭证审核，防止发生没有发票的支出。其次，在没有发票的支出出现的时候，可以制定补充性文件，例如商定函、支付记录，以确认支出的事实，做到实事求是的记账凭证。 另外，为了防止没有发票的支出事件，也可以通过自动化解决方案，比如建立企业管理系统，以便对采购流程进行全过程监控，防止发生没有发票的支出情况。 拓展知识：应急处理发票缺失的问题也是公司财务管理的重要内容。在应急处理的过程中，可以通过纸质凭证、双方确认函、电子发票等方式来解决发票缺失等问题，让发生缺失时，双方可以尽量减少财务风险和损失。