首先，在发现员工未扣个税的情况下，应首先加强对个税扣缴管理，对该员工进行严格处罚，责令其补缴，若未补缴，责令其受到后续处理。紧接着，我们需要尽快查明该期间未扣缴的个税金额大致情况，并将此记录到会计凭证上以便确认，同时可通过规章、规定等文件，尽快组织相关部门对缴纳的个税进行核对，以免向税务机关交纳滞纳金造成不必要的负担。 拓展知识：个人所得税的纳税义务是按月计算的，在每月月底个人需要提交报税表，由税务机关根据其月度收入来计算纳税额并及时缴纳税款，以免被处以滞纳金。