电子专用发票没有抵扣联，其留档主要有以下三种方式： 1. 电子数据存储：将发票数据以电子文件的形式进行存储，包括原件及复印件，存储位置可以是U盘、电脑中或云存储等； 2. 复印保存：打印出电子发票，进行复印，对发票缺少必要参数进行补充保证发票完整，将复印件作为发票留档； 3. 扫描归档：将发票原件扫描，以PDF格式储存，并将经扫描后的PDF文件放到专业的电子发票管理系统中进行归档，以保证发票的安全性。 拓展知识：电子发票是指在电子商务环境下，企业发放给客户的开票凭证，当企业采用互联网的技术、服务和系统，并通过网站、网络、互联网电子邮件发送给客户的发票就是电子发票。