支付代理记账公司服务费的记账方法： （1）在借方登记：银行存款——借，支付代理记账公司服务费——贷； （2）在贷方登记：支付代理记账公司服务费——借，应付账款——贷； （3）在费用项目登记：年终审计费、支付代理记账公司服务费等费用——借，应付账款——贷。 拓展知识：在支付代理记账公司服务费的记账中，还应缴纳税费，在费用项目中应再借加：应交税费，贷加：应付账款。