建筑工程行业小规模纳税人跨区需要办理外管证。根据目前国家财税制度的调整，跨区的征管工作已经取消了预交税款的要求，但是小规模纳税人仍然需要办理外管证。办理外管证需要准备的资料有营业执照、法定代表人身份证、税务登记证和税收征收服务协议书等，并且要提供电子版的营业执照照片和法定代表人身份证复印件等。办理外管证的审批过程通常比较快，一般在3~7个工作日就可以完成审批，不同地区所需审批时间可能会有所差异。