子公司A和子公司B应该按照回购收款协议规定进行账务处理。A应该以借款金额为借方，从应收账款科目借出；以发生的利息为贷方，结转到其他应收款科目，同时子公司B应该以本金为借方，从其他应收款科目借入；以发生的利息为贷方，结转到应收账款科目。 拓展知识： 委托收款协议是指当借款人和投资方(债权人)签订借款协议时，借款人在借款期限内偿还借款时，双方有关受托收款方将借款本金和利息收取并还给投资方(债权人)，由受托收款方代为收取借款本金和利息，而双方作出的协议。