增值税专用发票的抵扣联可以单独保管，也可以放入凭证和发票联一起存放，一般企业将增值税专用发票的抵扣联与凭证联或发票联存放在一起，以便查阅及审核用。保存时可以采取按日期存放、按类别存放、按月份存放等方式存放。此外，增值税专用发票还有办税人员抵扣联和校验码。办税人员抵扣联用于专用发票的交易信息备案，打印完整的校验码在购货方发票领货及实际使用上有一定的参考作用，可以防止发票被篡改。拓展知识：凭证联主要是指发票的购货方、销货方、金额等信息，是发票信息的绝对准确的承诺，如果凭证联存在错误，会影响发票的使用。