发票的开具是由发票的开票方负责的，贵公司的工程发生的收入是可以开具增值税发票的。根据《增值税暂行条例》第十条，增值税发票应当开具给取得货物或者提供劳务的购买人，并应当按照法律法规的规定开具。从法律角度来说，40万元的工程开13%的增值税发票符合法律规定，是可以开具的。 拓展知识：在增值税开票时，只有购买方才能有发票。增值税发票应当记载税务机关核定的税率，发票的金额不得低于付款人应付的税款金额，也不得超过核定的税率计算出的金额。