合作社入股款的账务处理应遵循以下步骤： 一、收取入股款：从入股者处收取一定的资金，登记收入科目账，须收取写明入股者所支付的股款额，同时将该笔款项记入入股集体的资本账户； 二、发出股票：入股款收到后，发出入股集体股票。按照入股者购入股票价值，以发行价格发出股票，发出股款须在科目账中记载购股份钱、股票发行价格等应发股票情况； 三、登记入股集体股本账：由发出股票人（入股集体）及入股者签署股权登记卡，在股本账户上登记收到的入股款及入股者的名称等情况； 四、登记入股股东账：入股者支付的股款及正式入股后，入股股东账上记载入股股东的姓名、股份数等情况。 以上是有关合作社入股款的账务处理简要介绍，实际操作中，还需记载相关的明细凭证，向税务机关申报缴纳税款，以及由章程规定的其他方面的处理等。 拓展知识：合作社的入股者只是拥有入股者的股权，而真正的所有权仍然归属于合作社，合作社的发展仍然由其董事会管理，而不由入股者决定。