您好，在发票开给分公司的情况下，可以从总公司的账户付款给对方。一般来说，从总公司的账户付款给分公司时，分公司应提供发票，由总公司将发票核对无误后，从总公司账户付款给分公司。此外，总公司也可以拒绝支付，该决定需要穿透总部管理层，并得到批准才能实施。要实现决策透明度，总公司可以使用审核流程管理软件，让支付流程在规定的审核框架内运作，并保护财务团队免受潜在的风险暴露。另外，可以利用账务软件设置自动账务审核，以确保财务安全性。