对于员工买的二套房的贷款，是可以申请专项扣除的，但是要满足一定的条件，首先，申请人必须是个人住房贷款，其次，申请人必须为房屋产权人，且房屋的面积必须小于140平米，房屋必须专用于自身居住，后者则是指首套房已还清贷款，且按期支付贷款未违约。另外，申请人还需要满足专项扣除标准，如有缴纳个人住房贷款利息，即可申请专项扣除。 专项扣除标准可分为两类：一类是适用于房屋购买期间利息支出，最高可扣除2万元；第二类是房屋使用期间支出的利息支出，最高可扣除15000元，具体情况具体分析。拓展知识：可以通过贷款购买多套房产，但仅首套房产可以申请专项扣除，其他购买的房产不能申请该项扣除。