是的，电子普票可以抵扣关税开。做账的方式主要有两种：一种是按照关税开的实际抵扣金额直接抵扣；另一种是采取差额法进行抵扣，即首先就本次关税报关开的实际关税数额乘以税率计算应纳税额数，然后减去抵扣电子普票的金额，就是实际应纳税额数。 拓展知识： 电子普票可以用于增值税、消费税、企业所得税等多种税种的税款抵扣，可以大大减少企业税负，提高企业现金流。此外，电子普票还可以用于货物报关，可以提升货物报关的效率，减少报关过程中的不必要开支和经费支出。