根据税务总局《运输合同印花税管理办法》，运输合同印花税的税率为0.05%，这是最新规定的税率，是比较低的税率。 运输合同印花税是以货物的价格和运输合同的质量和数量为基础，以税务机关核定的价格为计税依据，以统一计税比率计算征收的一种消费税。主要是针对商品运输合同收集，不同的省市可能会有不同的运输合同印花税税率。 此外，如果运输合同中的质量和数量未明确或者价格有重大变动，应该在运输合同双方签订后，向税务机关申报变更，并向税务机关交纳差额税款，以防止未缴或少缴税款而导致不必要的麻烦。