是的，如果分公司的收入超过500万元，它将被认定为一般纳税人，同时总公司也将被升级为一般纳税人。分公司缴纳税款的税率和方法取决于它所处的纳税人类别。一般纳税人的税率为25％，而小规模纳税人的税率为5％——17％之间。分公司可以根据其有关分公司的账户、营业执照及税务申报表等受益所得缴纳个人所得税。拓展知识：有关税收的其他方面，例如营业税、增值税等，分公司可能需要独立申报纳税，或者它可以与总公司进行合并申报。