根据《个人所得税法》规定，个人出租房屋、车辆、船只取得的租金收入应缴纳个人所得税。李某全年租金收入缴纳个人所得税的计算方法为： 首先，将收入54000元减去3000元的起征点，即得到净收入51000元； 其次，按照税率表，净收入51000元，所得税应当按照3%的税率计算，即应当缴纳个人所得税1530元。 个人所得税的税率多是按照分档缴纳的，根据国家的不同政策和收入的不同情况，税率会有所变动。个人所得税的纳税也受到一些优惠政策的影响，比如捐赠收据、居民习惯性支出等，都会对个人所得税的计算产生一定影响。此外，个人所得税计算还应考虑特殊工资、特殊费用、收入扣除等因素，以准确计算出个人所得税。