是的，员工开自己的车出差的加油费不能税前扣除。这是基于国家税务总局《关于完善企业和个人所得税报税政策的通知》（国家税务总局税发[2000]106号）中的规定。根据这一规定，开自己车出行的费用，不管是招待费、交通费、加油费用等，都不具备属于有效费用，因此不能税前扣除。 另外，一般情况下，可以税后抵扣的有效费用还有专程住宿费、租赁车辆费、招待费用，文物古玩费用，培训费用，参与会议费用，市场开拓费等。但是，这些有效费用都要符合税务机关规定的标准和条件才能享受税收优惠。 因此，如果要抵扣税收，不仅要遵循国家税务机关规定，还要选择符合税务机关规定的有效报销，同时要保存好各类收据，以备税务监管机关查询。